Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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