Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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