Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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