Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CEP290O15078 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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