Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SH3BP4Q9P0V3 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SH3BP4Q9P0V3 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SH3BP4Q9P0V3 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SH3BP4Q9P0V3 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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