Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms