Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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