Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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