Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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