Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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