Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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