Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXD4Q12950 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXD4Q12950 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXD4Q12950 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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