Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms