Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPS29P62273 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPS29P62273 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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