Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NMBRP28336 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NMBRP28336 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NMBRP28336 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NMBRP28336 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms