Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms