Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVV-1B6SEH8 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms