Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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