Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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