Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP5B1Q2VPB7 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms