Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SSPNQ14714 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms