Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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