Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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