Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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