Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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