Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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TCOF1Q13428 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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TCOF1Q13428 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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TCOF1Q13428 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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