Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms