Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms