Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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GPS1Q13098 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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GPS1Q13098 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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GPS1Q13098 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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