Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PTP4A2Q12974 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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