Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 LDB2-201ENST00000304523 2548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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