Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SREBF2Q12772 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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