Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms