Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CENPFP49454 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CENPFP49454 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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