Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms