Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 HYDIN-203ENST00000321489 3685 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ABCB4-206ENST00000453593 3699 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 DZANK1-204ENST00000358866 3310 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ANKRD55-203ENST00000504958 2139 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 LIMCH1-205ENST00000503057 5467 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 THY1-201ENST00000284240 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 LIPC-201ENST00000299022 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 KBTBD12-204ENST00000407609 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 CHRM2-202ENST00000401861 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ZKSCAN3-202ENST00000341464 1794 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AF111167.2-201ENST00000560419 4059 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 TERB1-202ENST00000433154 2446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 CTAGE9-201ENST00000314099 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 DEFA4-201ENST00000297435 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AL445426.1-201ENST00000427290 547 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AL442663.4-201ENST00000555304 289 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 HTT-AS1_2.1-201ENST00000621529 175 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RHAG-202ENST00000371175 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 SUN1-205ENST00000405266 4062 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ANTXRLP1-201ENST00000604933 1829 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 LILRA2-201ENST00000251376 4429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 CD44-206ENST00000415148 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AASS-202ENST00000393376 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 OVGP1-201ENST00000369732 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ZNF143-204ENST00000396604 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 MINDY3-201ENST00000277632 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 KIAA0825-201ENST00000329378 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 LPXN-201ENST00000395074 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 MORN5-201ENST00000373764 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 IGLV5-45-201ENST00000390296 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC103409.1-202ENST00000518416 577 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC004147.5-201ENST00000581727 536 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC004253.2-201ENST00000585025 397 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 AC233702.11-201ENST00000598588 333 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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