Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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