Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SNORA73.3-201ENST00000410213 189 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PUDPP1-201ENST00000421058 495 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RPL35P4-201ENST00000446039 322 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL109945.1-201ENST00000448134 687 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC027338.2-201ENST00000504382 526 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MIR4314-201ENST00000583321 92 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MIR4450-201ENST00000583589 65 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC007785.1-201ENST00000597989 332 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC013553.3-201ENST00000612943 615 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.120-201ENST00000614195 252 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 IGKV1D-35-201ENST00000442736 271 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RN7SL135P-201ENST00000490144 278 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 IGKV2D-14-201ENST00000522473 355 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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