Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4DQ92854 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms