Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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