Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms