Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms