Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF4Q15306 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms