Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms