Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms