Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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DDX39BQ13838 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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