Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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