Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms