Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 EIF4BP4-201ENST00000441847 1780 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CXCR6-201ENST00000304552 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RFX3-202ENST00000358730 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 LINC01644-201ENST00000405369 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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