Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SGCGQ13326 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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SGCGQ13326 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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SGCGQ13326 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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